Baten Kaitos, c'est vrai qu'il faut essayer.
C'est très spécial. Cependant, moi qui n'aime pas les jeux vidéo à base de cartes, j'ai vraiment adoré les combats de Baten Kaitos.
Sinon, Tales of Symphonia est très bon aussi, bien qu'un peu long à démarrer, et qu'hormis 2 scènes cinématiques en animé, la mise en scène est très mauvaise (pour ne pas dire absente).
Zelda bien entendu.
Et le must du must : Skies of Arcadia Legend.
Le jeu est un peu chiant au début, mais passées les premières heures de jeu, l'ambiance et le scénario se mettent en place, et on a affaire à l'un des meilleurs RPG jamais sortis sur console !
L'univers est riche, l'ambiance envoutante à souhait, le scénario long et plein de rebondissements et assure pret de 60h de jeu, sans compter les quètes annexes !
Bon faut pas être trop regardant niveau graphismes (c'est du niveau de la Dreamcast), et les combats navaux sont un peu lents, mais le reste vaut largement la chandelle.
Enfin, tu peux toujours essayer Paper Mario. C'est simpa et loufoque, mais je m'en suis vite lassé.
Sinon pour la DS, t'as Magical Starsign qui est simpa (mais j'y ai très peu joué donc je peux pas te dire sur la longueur).
Et à par celui là je sais pas

(mon coup de coeur sur DS, en revanche, et même si c'est pas un RPG, c'est Starfox Command)
Mais tu peux aussi te rabattre sur les RPG GBA : Breath of Fire I & II, les Final Fantasy, Sword of Mana, et surtout Golden Sun I & II